Skladište je ključni dio lanca nabave tako da je jedna od namjena ISUP-a i kontrola kretanja i smještanja materijala unutar skladišta kao i procesiranje vezanih transakcija, uključujući dostavu, prijem, smještaj i preuzimanje. Korisnik ima mogućnost da za ove namjene koristi i bar-code skenere i ručne kompjkutere koji se povezuju sa ISUP-om.

ISUP podržava funkciju skladištenja i tako daje sljedeće prednosti:

• korisnik nabavlja samo ono za čim postoji realna potreba
• obim nabave ne prevazilazi potrebne količine
• pregled stanja za kupce, partnere i dobavljače
• roba stiže "just in time"
• izbjegava se nagomilavanje, istek roka trajanja, manjak prostora i sl.
• Smanjeni troškovi krajnji rezultat

Da bi se ovo postiglo koristi se više kompleksnih algoritama koji omogućavaju projekciju potreba za materijalima u budućnosti. Koristeći zadate parametre i projekciju potreba, softver upozorava i preporučuje kada, šta i u kom obimu treba nabaviti da bi se zadovoljile potrebe poslovanja. Firme mogu imati jedno ili više fizičkih skladišta koja su distribuirana na širokom području sa različitim namjenama. Radeći na ovaj način, lokalni proizvodni i distribucijski centri imaju nadzor nad svojim funkcijama te imaju kompletnu sliku trenutnog stanja. Modul zadužen za skladište se povezuje sa ostalim modulim gdje postoji korist potreba za tim.